巧克力囊肿手术后半个月或一个月左右就可以正常上班。巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，是妇产科常见病和多发病。主要表现为痛经持续性加重，月经失调等症状，治疗目前分为药物和手术治疗，手术治疗是最佳的处理方法。一般来说保守手术后休息一周到半个月就可以正常上班，但是患者一定要注意术后护理，术后一定要禁止性生活，避免剧烈运动和重体力劳动一个月后可以恢复正常的性生活，术后要遵医嘱定时复查，并术后服用达菲林等药物预防复发。
巧克力囊肿手术恢复起来也很快，建议患者平时注意饮食，少吃辛辣刺激的食物，多进食清淡易消化的食物，比如鱼肉等，多吃新鲜的蔬菜水果补充维生素，才能更好地恢复。并注意个人卫生，勤洗澡，勤换内裤。平时注意定期复查子宫附件彩超，如果不适需要及时就医。