肾结石可以通过对因治疗、药物治疗或手术治疗等方式来消除，但多数情况下属于暂时性消除，多数会再复发。因此平时还应注意多饮水，以使每日尿量不少于2000ml，并维持饮食均衡，根据结石成分、代谢状态等调节食物结构，如高钙尿症患者要低钙饮食，草酸盐结石患者应限制浓茶、番茄、菠菜、花生等食物的摄入，高尿酸患者应限制海鲜、动物内脏等高嘌呤食物的摄入。
1、一般甲状旁腺瘤、尿路梗阻等可致使患肾结石，该类患者应积极治疗原发病，如切除甲状旁腺瘤或解除尿路梗阻，以避免结石复发。
2、肾结石小于0.6cm时，且结石以下尿路无梗阻的患者，可以在医生指导下用药物排石，如枸橼酸氢钾钠、乙酰半胱氨酸、氯化铵等药物治疗。
3、肾结石小于2cm的患者可选择体外冲击波或输尿管镜碎石等手术治疗，肾结石大于2cm的患者可以选择经皮肾镜碎石手术治疗。