两个月的宝宝肚子总是咕噜咕噜叫可能是由于肚子着凉、消化不良等因素导致的，建议前往专业医院，明确病因后在医生的指导下进行相应处理，可以通过物理方式、应用药物等手段进行治疗。
1.肚子着凉宝宝肚子着凉多是由于肚子呵护不当导致着凉或食用生冷食物等导致。常伴有腹泻、腹胀、腹鸣等症状。这种情况可以考虑采取物理疗法，可以用热水袋或热宝热敷腹部。同时可以在医生的指导下服用地衣芽孢杆菌活菌颗粒、乳酸菌素片等药物来进行治疗。
2.消化不良宝宝消化不良主要跟家长喂养不当以及先天性脾胃虚弱有关系，可以在医生指导下适当增加益生菌和助消化药来调理肠道菌群，改善消化，比如胰酶散、双歧杆菌活菌散等药物。平时在喂养上面应该少量多餐，不能吃太饱，可以配合进行顺时针腹部按摩进行缓解。