甲巯咪唑片治疗甲亢一般是有副作用的，其副作用包括白细胞减少、粒细胞减少、血小板减少、肝损害、皮疹、脱发、恶心、呕吐、头晕、头痛、关节痛等。甲巯咪唑片是一种抗甲状腺药物，可以阻碍甲状腺素及三碘甲状腺原氨酸的合成，从而起到治疗甲亢的作用。
使用甲巯咪唑期间应注意按时复查血常规、肝功能及甲状腺功能，避免出现白细胞减少及肝功能损害，同时根据甲状腺功能调整用药，若出现严重不良反应，也应及时调整用药或换药。应该注意的是哺乳期妇女禁用甲巯咪唑，对甲巯咪唑过敏者也应禁用，中度及重度血细胞减少的患者禁用，用药需严格遵医嘱。甲亢患者应注意避免进食富含碘的食物，如海鲜、海带、紫菜等。