小便灰色发暗，多数是饮食不当、外伤造成的，但不排除是尿道炎、膀胱炎、肾小球肾炎等原因导致的，需要及时去医院进行检查，然后在医生的指导下进行治疗。
1、饮食不当：如果不注意饮食健康，经常吃深颜色的食物，比如蓝莓、桑葚等，可能会改变尿液的颜色，出现灰色的情况。这属于一种正常的现象，一般不需要特殊治疗，也不需要过分担心。
2、外伤：如果尿道部位受到猛烈的撞击，可能会损伤周围的组织，也有可能会出现尿液颜色异常的情况。建议及时补充水分，多喝温水，能够减轻不适症状。
3、尿道炎：多数是尿道部位受到细菌感染所致，可能会产生较多的炎性渗出物，容易出现尿频、尿液颜色暗沉等情况。建议遵医嘱使用阿莫西林胶囊、盐酸莫西沙星片等药物治疗，抑制细菌生长。
4、膀胱炎：通常是膀胱部位受到病原微生物感染所致，随着病情发展，可能会出现腹部疼痛、尿液颜色发深等情况。建议遵医嘱使用盐酸环丙沙星胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等药物治疗，抑制炎症反应。
5、肾小球肾炎：通常是家族遗传、感染等原因造成的，可能会导致肾脏的滤过功能下降，引起血尿、晨尿颜色为烟灰色、水肿等症状。建议遵医嘱使用呋塞米片、氢氯噻嗪片等药物治疗，促进尿液排出。
在日常生活中，养成及时排尿的好习惯，避免长时间的憋尿，否则会加重上述不适。