通常情况下脑血栓和脑梗塞都是指缺血性脑血管疾病，都是脑血管堵塞造成脑组织的缺血、缺氧、坏死等现象。但脑血栓和脑梗塞也有一些不同，常见的区别有疾病范围不同、起病形式不同等。
1.疾病范围不同脑梗塞是指局部脑组织因血液循环障碍，导致缺血、缺氧性坏死，进而出现相应的神经功能缺损。根据脑梗塞的临床表现和发病机制，一般将脑梗塞分为脑栓塞、腔隙性脑梗死等，脑梗塞相比较脑血栓更为严重。脑血栓在范围上脑血栓被包括在脑梗塞范畴内，只是脑梗塞的一种特殊类型。
2.起病形式不同高血压、糖尿病都可能会引发脑梗塞，并且脑梗塞发病急，病情重，数分钟或数小时以内可达到高峰，根据梗塞部位的不同，表现出不同程度的临床症状，需要及时就医救治。脑血栓常因高血压、糖尿病、酗酒吸烟、长期高盐饮食的人群等原发病或不良生活习惯而引起的，起病比较缓慢，症状可于数小时或数天达到高峰，病情临床表现、轻重程度都不一样。