一般来说肚脐眼是不需要清理的。肚脐在中医上称之为神阙穴，指胎儿出生后，脐带脱落后留下的疤痕。肚脐位于髂前上棘水平的腹部正中线上，直径约为1.0厘米到2.0厘米，可表现为凹陷或突出。肚脐一个藏污纳垢的地方，里边的污垢，可以保持正常肚脐温度，如果太干净，热量会散发较快，肠胃功能可能会受损。
若是在病态的情况，如脐炎、脐尿管未闭等疾病导致的肚脐内分泌物产生，建议可在医生指导下对肚脐眼进行清理，具体清理的方法是用湿润的棉签将肚子里的污垢、灰尘轻轻拨出，而不是暴力的用手指甲去抠除肚子里的污垢、灰尘；如果脏东西位置比较深，无法用棉签清理，可以用镊子，先将肚脐消毒，再用无菌的镊子将脏的污垢或分泌物轻轻地夹除，避免用没有消毒过的东西去清理肚脐。