脂肪瘤和皮脂腺囊肿的区别有表面形状、性质、位置不同。皮脂腺囊肿与脂肪瘤都属于体表良性肿瘤。皮脂腺囊肿可以通过药物和手术切除等方式治疗，若囊肿较小可以通过局部涂抹甲硝唑凝胶、红霉素软膏等消炎药物治疗；囊肿较大需要进行手术切除治疗。脂肪瘤一般是通过手术切除，可以预防脂肪瘤恶变风险。
1、表面形状皮脂腺囊肿有异常颜色，和正常皮肤有所区别；而脂肪瘤和正常皮肤没有区别。
2、性质皮脂囊肿里面是分泌受阻的皮脂腺浓缩、凝固而形成的囊肿，多为豆腐渣样质，属于良性肿瘤，在细菌感染、摩擦、挤压等因素刺激下，会出现局部红肿、感染。脂肪瘤是局部脂肪组织堆积生成的瘤样增生，一般没有症状，不会发生感染，少部分会有疼痛感。
3、位置皮脂腺囊肿多见于皮脂腺分布密集的地方，如头部、面部、背部等位置；脂肪瘤多见于四肢躯干、后背部等，表现为边界清楚、质地柔软的局限性肿块。