一般情况下，喉咙不舒服不会影响核酸检测结果。喉咙不舒服通常是由于饮食不当或者细菌感染等原因引起，通常表现为急性咽喉炎或者扁桃体炎等病症，而核酸检测通常是通过咽拭子或者鼻拭子来提取咽喉部位或者鼻部位的分泌物、上皮细胞等来进行病毒的检测。
喉咙不舒服的患者需要及时的查明病因，并且进行相应的治疗，例如患者可以遵循医嘱使用止痛类、消炎类的药物来进行治疗，如阿莫西林、罗红霉素等。在日常生活中要多饮水，提高身体的新陈代谢能力，促进身体内毒素的排出，也可以适当的食用富含维生素的水果和蔬菜来增强身体的免疫能力，在一定程度上帮助身体恢复。此外患者应当避免食用生冷、辛辣、刺激类的食物，以免加重咽喉部位的症状。