打完九价疫苗一般是不会影响月经的。九价疫苗主要是通过刺激人体的免疫系统导致抗体出现，与免疫系统有关。而且没有具体的不良反应会出现对月经产生影响的现象。
打完九价疫苗后女性出现月经不调的情况，一般和疫苗无关，多数可能是由于自身压力过大、熬夜或者是体内激素调节水平紊乱等问题所造成。建议女性平时要保持健康的生活方式，少吃辛辣刺激的食物，保持营养充足，不要过度节食，要学会调节释放自己的压力，保证充分的休息时间。必要时还可以在医生的指导下进行药物调理，如益母草颗粒、乌鸡白凤丸等。
一般情况，在接种后可能会出现头晕、头痛、恶心及肌肉关节疼痛等现象，严重的甚至还有晕厥的情况，需要及时告知医生，根据情况来进行缓解和治疗，因此通常建议在接种完九价疫苗要留观30分钟，在没有发生任何不适的情况下才可以离开。还有接种九价疫苗可能会出现在接种部位有红肿、疼痛现象，多属于正常情况，不需要过于担心，2天左右就可以自行缓解。