一般情况下胆结石手术可以进行核磁共振检查，但是建议患者可以先做超声检查，超声检查的准确性较高、敏感性较强以及特异性的无辐射检查，是大部分患者的优先考虑的检查方法。胆结石患者可做的检查还有CT、彩超等，但因患者个体存在差异，部分患者结石情况无法通过以上检查检测出时，可以再通过核磁共振检查了解病情。
肠胀气的患者可能会影响超声检查的检查结果，胆结石的患者需要进一步通过核磁共振达到检查目的。当患者体内结石极其细小时，CT及彩超无法明确进行诊断，此时通过核磁共振的MRCP检查，能够帮助医生检查胆结石有无脱落至胆总管。此外，对于部分患者治疗方式的差异，术前进行核磁共振检查能够帮助手术顺利进行。