通常情况下，没有济生肾气丸和金匮肾气丸哪个最好的说法。济生肾气丸和金匮肾气丸在药物成分、针对的病症方面存在不同之处，需要根据患者的实际病情进行选择，并且药物的使用需要在医生检查指导下进行。
1、药物方面济生肾气丸和金匮肾气丸中相同的药材有牡丹皮、泽泻、山药、牛膝、附子、山茱萸、茯苓，除此之外，济生肾气丸还包含有熟地黄、肉桂。而金匮肾气丸还包含有生地黄、桂枝等药材。
2、适应症方面济生肾气丸主要针对肾虚导致的水肿、小便不利、膝盖疲重等症状，主要用于温肾化气。而金匮肾气丸用于温补肾阳，主要适用于肾虚水肿、畏寒肢冷。