一般情况下，恶性肿瘤基因检测阴性好不好需要根据具体情况进行判断，不能单纯通过结果的阴性和阳性来判断好坏。如果检测结果为阴性说明患者的基因没有产生突变，可能不能使用靶向药物进行治疗，但是仍然可以采取手术联合化疗等方式进行治疗，也可以取得较好的治疗效果。
恶性肿瘤患者做基因检测通常是为了寻找特异性靶点，从而选择适合的靶向药物进行治疗，可以为患者提供更有针对性的治疗方案，如果肿瘤细胞对于靶向药物比较敏感，一定程度上可以提高患者的治疗效果。无论检测结果如何，患者都应该积极配合医生进行治疗，保持良好的心态。