一般情况下，HPVE6E7MRNA阳性说明感染了高危型HPV病毒，建议积极进行治疗，通常采取应用药物、物理治疗、手术等方式进行治疗，治疗需遵医嘱。
1、应用药物HPVE6E7MRNA阳性通常说明病毒处于活跃期，感染的时间已经比较长，需要积极进行抗病毒治疗。可以在医生指导下使用重组人干扰素α-2b栓、保妇康栓等药物进行治疗，促使HPV达到转阴的效果。
2、物理治疗如果HPVE6E7MRNA阳性感染的时间较长，并且通过应用药物不能有效清除，可以通过激光、微波、冷冻等方式灭杀病毒，破坏病毒生存的环境，可以起到病灶坏死、脱落，达到治疗的效果。
3、手术如果患者有宫颈肥大、宫颈柱状上皮异位等症状，可以遵医嘱采用子宫颈环形电切手术、宫颈锥切术等方式来治疗。
除了上述治疗方式以外，患者在治疗期间要注意饮食，保证营养均衡，增强抵抗力，可以多摄入优质蛋白的食物，增强患者抵抗病毒的能力。