一般情况下，打了狂犬疫苗后第三天不舒服需要及时前往医院进行检查，查明病因后，进行针对性治疗。通常狂犬疫苗的不良反应为接种处红肿、疼痛等，发生时间多为接种后不久，所以基本可以排除疫苗的不良反应。在疫苗接种三天后身体不舒服，可能是伤口发生感染或者其他原因导致，需要进行更为全面的检查，根据病因进行治疗。
患者在接种狂犬疫苗后，如果伤口发生感染，可以在医生指导下，应用阿奇霉素分散片、克拉霉素缓释片等抗感染药进行治疗。同时患者应注意生活习惯，不要食用辛辣有刺激性的食物，合理调整膳食结构，均衡营养，保证身体摄入足够的必需的营养物质，不要暴饮暴食，注意休息，规律作息，保证睡眠时间和睡眠质量，避免内分泌失调的发生。患者可以适当进行身体锻炼，增强免疫力。