通常头两侧胀痛眼睛酸可能是由于青光眼、眼疲劳等原因导致，建议患者在患病后及时前往医院，在医生的指导下通过应用药物、手术等方式进行治疗。
1.青光眼通常青光眼是由于遗传、眼部钝挫伤等原因导致的，患者在患病后通常会出现头痛、眼痛等症状，因此头两侧眼睛酸可能是由于青光眼所引起的，所以建议患者在医生的指导下使用硝酸毛果芸香碱滴眼液、布林佐胺滴眼液等药物进行治疗，若病情严重则可以在医生的建议下通过激光虹膜周边成形术、前房穿刺术等手术方式进行治疗。
2.眼疲劳眼疲劳的发病原因主要是近视、用眼过度等因素导致的，通常情况下该种疾病会导致患者出现头疼、眼睛酸胀等症状，所以这可能是造成头两侧眼睛酸的原因，因此患者在患病后应当遵医嘱通过应用七叶洋地黄双苷滴眼液、透明质酸钠滴眼液等药物进行治疗。