一般情况下，睡醒肚脐眼上面疼可能是肠痉挛、肠炎、胃炎等因素引起的，可通过药物治疗和改变饮食结构等方式进行处理。睡醒肚脐眼上面疼的原因以及治疗方式还可见其他，建议患者前往医院，并在医生的指导下根据具体情况进行相应处理。
1、肠痉挛肠痉挛可能是由于患者摄入了大量不干净的食物刺激肠道引起的，通常会出现腹部绞痛、呕吐等症状。可根据医嘱应用消旋山莨菪碱片或颠茄片等药物进行治疗。建议在日常的生活中少吃生冷刺激性食物，如生鱼片、雪糕等，吃饭时应注意细嚼慢咽。
2、肠炎多因细菌、病毒、真菌等感染所致，症状多表现为腹痛、腹泻、恶心、呕吐等，亦可出现睡醒肚脐眼上面疼的状况。通常可遵医嘱应用对乙酰氨基酚片、蒙脱石散等药物镇痛止泻，双歧杆菌活菌活菌胶囊等调节肠道功能。
3、胃炎胃炎可能是由于胃酸增多或胃内壁保护性粘液减少等原因导致的，通常会出现肚脐眼疼痛、腹胀、恶心等症状。可根据医嘱应用奥美拉唑肠溶片或兰索拉唑肠溶片等药物治疗。