一般情况下，睡醒后肩膀后背疼痛的原因可能是过度劳累、肌筋膜炎、运动损伤等原因导致的。通常可以通过调整生活方式、应用药物、理疗等方式进行治疗。
1.过度劳累如果睡前因过度劳累或者进行了过量运动，可导致局部乳酸堆积，引起睡醒后肩膀后背生理性酸痛。建议患者在日常生活中应避免繁重工作，调整作息方式，多休息。
2.肌筋膜炎肌筋膜炎是由于免疫功能差者易致病，通常是肩颈腰部肌肉、韧带、关节囊急性损伤或慢性劳损所致。在医生指导下，可以通过应用盐酸乙哌立松片、塞来昔布胶囊等药物进行治疗。
3.运动损伤因白天重体力劳动或剧烈运动导致肩膀后背肌肉、筋膜损伤，早晨起来再活动可致原损伤部位受到牵拉会出现疼痛。可以用冷水淋洗伤部或用冷毛巾进行冷敷等方式进行治疗。