宝宝病毒感染发烧三天还没退，可能是由于病情还没有得到有效控制，可以在医生的指导下给宝宝服用抗病毒口服液或者小儿豉翘清热颗粒等药物进行治疗，同时也要注意观察宝宝的体温情况。
如果体温在36℃到37℃之间，可以用物理降温的方法给宝宝进行降温，用热毛巾擦拭宝宝的额头、颈部、腋窝、四肢躯干以及腹股沟等血管比较丰富的部位，有利于帮助宝宝的散热，如果体温超过了38.5℃以上，应在医生的指导下口服布洛芬颗粒、对乙酰氨基酚泡腾颗粒等退烧的药物进行治疗。
如果病情比较严重，建议及时带宝宝到正规的医院进行C反应蛋白、血常规、支原体以及尿常规等相关的检查，同时做肺部CT或者胸片等辅助诊断，尽早查明病因及时治疗，争取早日康复。在治疗期间应多让宝宝喝一些温开水，有利于身体的新陈代谢。