12岁女孩短裤上有褐色分泌物，可能是由于生理因素或者尿路感染等原因引起的。家长需根据女孩的病情，选择治疗方式。
1、生理因素。12岁女孩短裤上有褐色分泌物，由于女孩月经初潮引起的。因为12岁女孩已经进入青春期，身体会在雌激素的作用下开始发育，比如乳房开始增生长，有月经初潮等情况，属于正常的生理现象。家长一定要做好孩子的心理辅导，让孩子正确认识身体的变化。
2、尿路感染。12岁女孩短裤上有褐色分泌物，可能是由于尿路感染引起的。尿路感染通常是由于没有做好私处卫生，导致细菌从尿道侵入人体，引起了尿路发炎。会出现尿频、尿急或者有褐色分泌物等症状，需在医生指导下服用药物治疗，常用的药物有青霉素或者头孢克肟颗粒等。