吃了酵素拉肚子通常属于正常反应，但过量摄入可能会导致胃肠道系统出现异常，发生腹泻诱发头晕的情况。而吃完酵素出现拉肚子头晕的情况不排除可能是机体对酵素产生过敏反应。
吃酵素会引起腹泻，而腹泻通常会表现出脱水，从而出现头晕胃肠道功能紊乱以及肠道菌群失调所引起的，所以会出现吃了酵素拉肚子，患者在日常生活中应注意补水、补充电解质，还可以在医生的操作下注射氯化钠注射液、氯化钾注射液等，不当使用会出现恶心、呕吐、咽部不适等症状，过敏体质者禁用。
酵素含有大量糖素对人体有一定的好处，但对不适应人群会产生很多不良的副作用，酵素在发酵过程中会产生大量的酵菌，体质过弱的人群可能会出现冷汗、腹痛等症状，所以吃了酵素会拉肚子。