大番茄和小番茄的营养可能是一样的，两种食物属于一个品种，食物中的营养并不会出现较大的差异。番茄中含有较为丰富的粗纤维、碳水化合物、蛋白质、维生素等营养物质，也含有一定量的钾、磷、铜、镁等微量元素，适量食用大番茄或小番茄，能够补充人体所需的营养物质以及微量元素，也可以对提高免疫力起到一定的帮助。并且适量食用大番茄或小番茄，能够对人体起到补充营养、促进消化等作用，但不建议过量食用。
在食用番茄的过程中，番茄中含有一定量的苹果酸、柠檬酸等酸性物质，在进入肠胃后会对胃黏膜产生一定的刺激，使胃液分泌量改变，进而会引起胃痛的现象。并且番茄中的酸性物质，会使肠胃中的胃酸分泌较多，从而引起反酸、烧心等不适症状。