三个月宝宝睡醒不睁眼就哭可能是由于饥饿、缺乏安全感、受到惊吓等原因引起的，可根据具体原因采取不同的处理方法。
1、饥饿。如果宝宝在睡觉时感到饥饿，可能会出现睡醒不睁眼就哭的现象。建议家长及时进行喂养，改善宝宝的饥饿状态。
2、缺乏安全感。如果宝宝睡觉时家长没有陪在身边，宝宝醒了之后感觉到孤单，可能会由于缺乏安全感，出现睡醒不睁眼就哭的现象。建议家长尽量陪在宝宝身边，以免对宝宝的心理健康造成影响。
3、受到惊吓。宝宝在熟睡中，由于周围环境过于嘈杂或者突然巨响，就会使宝宝受到惊吓而导致惊醒，出现睡醒不睁眼就哭的现象，建议尽量让宝宝在安静舒适的环境中入睡，以免影响到睡眠质量，不利于宝宝身体的生长发育。