一般情况下，宝宝嘴巴臭臭的半夜哭闹可能是生理性因素或者消化不良等原因引起，建议通过改善生活习惯、应用药物等方式治疗。
1.生理性因素家长喂养习惯不良或者忽视宝宝口腔卫生等生理性因素可能导致宝宝口腔内残留食物残渣以及乳汁，进而滋生口腔细菌，出现宝宝嘴巴臭臭的情况。建议家长在喂养宝宝后，及时给宝宝喂些水，同时每天用棉棒蘸淡盐水给宝宝擦拭口腔，防止细菌滋生。
2.消化不良一般情况下，经常性给宝宝进食不易消化的食物或者喂养过多等不佳的饮食习惯可能导致宝宝消化不良的情况，可能伴随腹痛、腹胀、口臭等表现。建议宝宝辅食尽量以易消化的食物为主，同时控制喂养量，避免喂养过多引起消化不良。还可遵医嘱给宝宝应用复方胃蛋白酶颗粒、枯草杆菌二联活菌颗粒等药物进行治疗。