贝肠宁和克痢肽主要区别是药物的成分是不一样的，功效也是不同的，在平时使用药物的时候一定要谨遵医生治疗，这样才可以达到较好改善疾病效果，尽量不要擅自使用药物，避免对身体健康造成严重影响。用药期间也要合理膳食。
1、里面的成分不同：贝肠宁主要的成分是低聚木糖，克痢肽里面的成分是溶菌酶、谷氨酰胺和甜菊素等。
2、功效不同：贝肠宁主要的功效是可以增殖体内有益菌，调理肠道菌群，克痢肽主要功效是可以杀死体内一些有害菌。