1、子宫颈或内膜粘黏
在进行人工流产时，如果医师的手法太过粗鲁，就很有可能导致子宫颈或内膜受伤、发炎，就有可能产生术后的子宫颈或内膜粘黏、并会引起月经异常，如无月经或月经量过少。严重者会在以后产生不育症的情况。
2、子宫颈受伤
在人流的过程，如果不小心，扩张宫颈口的速度太快，都有可能造成子宫颈的损伤，并造成以后怀孕较容易流产的情形，尤其是第一次怀孕或尚未生育过的妇女比较容易发生。
3、子宫穿孔
妊娠周数愈大，危险机率愈高，流产次数愈多，穿孔机会也愈大。其它如子宫位置、形状异常或以前动过手术的子宫皆有较大的穿孔机会。
4、不完全流产
如果手术施行不完全，少量胎儿组织残留于子宫内，可能影响子宫收缩而造成持续出血或造成粘黏、感染等情况。要再仔细做一次手术清除残余的组织。子宫的位置或形状不正常，一般比较容易造成此后遗症。
5、细菌感染
如果器械消毒不完全，或是手术者本身未注意无菌过程，即可能造成子宫内感染，甚至继续往上传染侵犯输卵管及骨盆腔，严重时会造成以后宫外孕或不孕的后果。