16岁拔智齿有一定的危害，拔除智齿的过程中，可能会损伤大量的牙齿和牙龈，从而导致血液出血，甚至可能会造成感染，出现口腔疾病。此外，拔智齿的过程可能会破坏牙根，影响牙齿的完整性，并导致牙齿渗漏，牙齿变黄、变脆等问题，最终会影响牙齿的正常功能及外观。因此，拔智齿前一定要咨询口腔医生，认真了解拔智齿的风险和注意事项，以确保口腔健康。