长期服用金嗓散结胶囊可能会有多种副作用。其中包括：头晕头痛，可能由药量过大损伤神经引起；消化不良、反酸烧心，尤其在肠胃功能较差的患者中更常见；腹泻，特别是肠胃不佳者；以及过敏反应，如皮肤发红、瘙痒等，主要发生在体质敏感的患者中。此外，还可能出现心血管系统反应如心律失常。若感到不适，应及时就医。