口腔黏膜内颚处一吃东西就会起透明小水泡

根据你的描述,一般判断不是智齿的问题,很有可能是粘液腺囊肿,建议你去口腔科做进一步检查,如果确定是囊肿,就需要通过小手术把它切除。