耶氏肺孢子菌性肺炎的病理生理表现为:耶氏肺孢子菌仪局限于肺部，肺组织可能被破坏，但更常见的是肺泡内充满微生物和炎性分泌物。未经处理的弥漫性肺部感染可导致低氧血症性呼吸衰竭，病人死亡。患有艾滋病的患者很容易感染这个疾病，艾滋病患者这时要积极服用艾滋病相关药物。