脚小指甲发黑可以在医生的指导下使用抗真菌的药膏进行治疗，比如水杨酸药膏，另外也可以服用伊曲康唑胶囊进行治疗，也具有抗真菌的效果，一般用于改善甲真菌疾病所引起的症状。如果是外伤或者挤压所造成的，可以在医生的指导下服用活血化瘀类的药物进行治疗，比如当归。平时要多休息，避免过度劳累。