慢性反流性肾病的病因目前一般认为与膀胱粘膜下输尿管长度、直径肌组织、神经支配等先天缺陷有关,因为输尿管口异位引起粘膜下部分输尿管过短,对此有重要意义。膀胱充盈时,输尿管粘膜下部分可能进一步缩短而出现反流。这与仅在膀胱充盈时或排尿期间观察结果一致。