头皮毛囊萎缩可能会恢复，具体需要看个人的情况。如果头皮毛囊萎缩的不严重，能够使用药物治疗，如果毛囊萎缩的比较严重，使用药物的效果不是很好，可以种植头发，种植头发是选择后枕部健康的毛囊，把健康的毛囊移植到萎缩的部位，可以长出新的头发。