扁平疣去除一般可以选择药物治疗、激光手术、液氮冷冻治疗等，具体需要根据扁平疣的病情轻重程度决定。
1、药物治疗
扁平疣的病情不是特别严重，面积比较小，可以及时采取药物治疗，比如遵医嘱外部涂抹上咪喹莫特乳膏、维A酸软膏等，能够逐渐的消除扁平疣，涂抹在患处之前，需要将病变的位置清洗干净，病情严重的时候还需要配合上口服药物治疗，比如异维A酸胶囊、阿昔洛韦片等。
2、激光手术
主要是通过激光仪器所发出的一种光热原理，能够使局部的组织快速的坏死，达到去除的效果，创伤比较小，恢复的也比较。
3、液氮冷冻治疗
主要是通过冷冻的原理，可以使局部的扁平疣逐渐的坏死去除。
除此之外，也可以通过传统手术切除、微创手术、开放手术等治疗，也有利于症状得到缓解。