阿奇霉素吃3天后还咳嗽可能是因为患者病情还未痊愈，但较前有减轻，或患者所感染的病原体对阿奇霉素不敏感，再者就是患者的咳嗽不是感染所引起的，所以用阿奇霉素抗感染治疗无效。
建议患者明确病因，最好做个痰培养+药敏，再针对性治疗。如果患者咳嗽属于感染所致，且阿奇霉素能够覆盖所感染的病原体，则可再继续服用阿奇霉素2天并观察病情。若感染的病原体对阿奇霉素不敏感，可根据痰培养+药敏试验结果改用合适的抗生素抗感染治疗。若为病毒所致的咳嗽，需停用阿奇霉素，必要时可给予利巴韦林或奥司他韦抗病毒治疗。对于上述针对病因治疗后咳嗽控制不佳的情况，可以加用强力枇杷露或京都念慈菴蜜炼川贝枇杷膏进行止咳化痰治疗。