牙齿根部缝隙疼痛可能是牙龈炎、牙周炎或龋齿等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.牙龈炎：牙龈炎是牙齿根部缝隙疼痛的常见原因之一。牙龈炎多由牙菌斑和牙结石刺激牙龈引起，表现为牙龈红肿、出血等症状。治疗牙龈炎可使用消炎药物如甲硝唑、阿莫西林和罗红霉素等，同时注意口腔卫生，定期洗牙。
2.牙周炎：牙周炎是牙龈炎的进一步发展，表现为牙齿松动、牙槽骨吸收等。牙周炎的治疗需要进行牙周刮治、牙周手术等，同时使用抗生素如克林霉素、阿奇霉素和甲硝唑等控制感染。
3.龋齿：龋齿是牙齿根部缝隙疼痛的另一种可能原因。龋齿多由口腔内细菌分解食物残渣产生酸性物质，导致牙齿脱矿和破坏。治疗龋齿需要进行补牙或根管治疗，同时使用氟化物牙膏预防龋齿。
除以上原因外，牙齿根部缝隙疼痛还可能与牙齿磨损、牙齿折裂等因素有关。建议日常注意口腔卫生，定期进行口腔检查，发现问题及时就医治疗。