掏耳朵时咳嗽可能是由于耳道和喉咙的反射性刺激、耳道感染或耳垢过多等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.耳道和喉咙反射性刺激：当耳道受到刺激时，可能会引发咳嗽反射。这种反射是身体的一种保护机制，以清除可能进入耳道的异物。例如，使用棉签或其他工具掏耳朵时，可能会不小心触碰到耳道内的敏感区域，从而引起咳嗽。
2.耳道感染：耳道感染，如外耳道炎，可能导致耳道内部肿胀和疼痛，这种不适感可能会刺激喉咙，引发咳嗽。治疗耳道感染通常需要使用抗生素滴耳液，如氧氟沙星滴耳液、氯霉素滴耳液和新霉素滴耳液等，但应在医生指导下使用。
3.耳垢过多：耳垢积累过多可能会压迫耳道，引起不适和咳嗽。在这种情况下，医生可能会建议使用耳道清洁剂，如碳酸氢钠溶液，或者进行专业的耳道清洁。
除以上原因外，还可能与过敏反应等因素有关。日常生活中应避免使用尖锐工具掏耳朵，以免造成损伤。如果咳嗽持续不缓解，应及时就医检查。