肛瘘通常不会自愈。肛瘘是肛管与皮肤之间的异常通道，通常由肛周脓肿破溃后形成。由于其结构特点，肛瘘很难通过自身修复机制愈合，往往需要手术治疗。
肛瘘的治疗方法主要包括手术和药物治疗。手术治疗是根治肛瘘的主要方法，包括切开引流术、瘘管切除术等。药物治疗主要用于缓解症状和辅助手术治疗，如复方黄连素片、消炎利胆片、甲硝唑片等。这些药物可以减轻炎症反应，缓解疼痛，但并不能根治肛瘘。患者在使用药物治疗时，应在医生指导下合理用药，避免药物不良反应。
对于肛瘘患者，建议尽早就医，明确诊断后根据病情选择合适的治疗方法。手术治疗是根治肛瘘的有效手段，药物治疗可以辅助缓解症状，但需在医生指导下使用。同时，患者应保持良好的生活习惯，避免便秘和腹泻，以减少肛瘘的发生。