怀孕六周是可以做药物流产的。药物流产通常适用于怀孕49天以内的女性，此时胚胎较小，药物流产的成功率较高。但值得注意的是，药物流产并非适合所有女性，需要在医生的指导下进行。
药物流产主要使用米非司酮和米索前列醇两种药物。米非司酮可以阻断孕激素的作用，使胚胎停止发育；米索前列醇则可以引起子宫收缩，促使胚胎排出体外。此外，还有如甲氨蝶呤等药物也可用于药物流产，但使用时需严格遵循医嘱，避免出现不良反应。
药物流产虽然相对简单，但仍存在一定的风险，如出血过多、流产不全等。因此，建议在医生的指导下进行药物流产，并在流产后及时复查，确保身体恢复正常。同时，要注意保持良好的心态，避免过度紧张和焦虑。