始基囊肿通常不是含牙囊肿。始基囊肿是一种发生在牙胚发育早期的良性肿瘤，而含牙囊肿则是一种与牙齿发育有关的病变。
始基囊肿和含牙囊肿虽然都与牙齿发育有关，但它们的病因、临床表现和治疗方法存在差异。始基囊肿多发生在儿童时期，表现为颌骨内无痛性肿块，X线片上可见圆形或卵圆形的透光区，而含牙囊肿则多发生在成人，常伴有牙齿发育异常或阻生，X线片上可见囊性病变包围着牙齿。治疗始基囊肿通常采用手术切除，术后一般不会复发。含牙囊肿的治疗则需要根据具体情况选择手术切除或牙齿牵引等方法。
在治疗过程中，可能需要使用一些药物来辅助控制炎症和缓解症状。常用的药物包括消炎止痛药如布洛芬、抗生素如阿莫西林以及激素类药物如地塞米松。但具体用药方案应在医生指导下进行，以确保安全有效。
总之，始基囊肿和含牙囊肿虽然都属于牙源性病变，但它们在病因、临床表现和治疗方法上存在明显差异。患者在发现颌骨内肿块时应及时就医，明确诊断后根据医生建议选择合适的治疗方案。