眼睛有滤泡通常是指结膜炎的一种表现，治疗方法主要有药物治疗、物理治疗和病因治疗等，一般需根据具体情况进行选择。
1.药物治疗：对于轻度的结膜炎，可以使用抗生素眼药水如氯霉素滴眼液等，以控制感染。若症状较重，可使用糖皮质激素类药物如地塞米松滴眼液，但需在医生指导下使用，避免长期使用。
2.物理治疗：对于症状较重的结膜炎，可采用热敷、冷敷等物理疗法，以缓解眼部不适。同时，保持眼部清洁，避免揉眼，以免加重病情。
3.病因治疗：对于由过敏、病毒感染等原因引起的结膜炎，需要针对病因进行治疗。如过敏性结膜炎可使用抗过敏药物如酮替芬滴眼液等；病毒性结膜炎则需使用抗病毒药物如阿昔洛韦滴眼液等。
眼睛有滤泡时，除了及时就医外，日常生活中也要注意眼部卫生，避免眼部疲劳，多休息，保持室内空气流通，以降低结膜炎的发生风险。