牙根囊肿一般不会自行消失，如果不进行适当治疗，可能会带来一系列问题。牙根囊肿是由牙根感染引起的，如果不去除，感染可能会扩散，导致邻近牙齿和颌骨的进一步破坏。
牙根囊肿如果不及时治疗，可能会逐渐增大，压迫周围的牙齿和颌骨，引起疼痛和牙齿移位。随着囊肿的增长，可能会形成窦道，即囊肿与口腔表面之间的通道，导致反复感染和化脓。此外，囊肿的存在还可能影响咀嚼功能，甚至影响面部外观。在一些严重的情况下，如果不及时治疗，牙根囊肿还可能引起颌骨骨折或颌骨骨髓炎等并发症。
对于牙根囊肿，日常建议保持口腔卫生，定期进行牙科检查。一旦发现牙根囊肿，应及时就医，医生会根据囊肿的大小、位置和感染程度来决定最合适的治疗方法。通常，治疗牙根囊肿需要进行手术切除，并可能需要配合抗生素治疗以控制感染。在治疗过程中，应严格遵循医嘱，不可自行盲目用药，以免延误病情或引起其他并发症。