一般而言，三九天艾灸的最佳时间是在早晨太阳初升之时，因为此时阳气开始上升，人体阳气也随之增强，艾灸的效果更佳。
三九天，即冬至后的三个九天，是一年中最寒冷的时期。在这段时间内，人体阳气相对不足，容易受到寒邪的侵袭。艾灸作为一种温阳散寒的传统疗法，通过点燃艾条，利用艾草的温热性质和药物作用，对穴位进行温热刺激，以达到温经散寒、调和气血的目的。早晨是人体阳气开始活动的时候，此时进行艾灸，可以更好地促进阳气的升发，增强人体的抵抗力。此外，早晨空气清新，环境较为安静，也有利于艾灸的效果发挥。
在进行艾灸时，建议选择经验丰富的中医师进行指导，以确保艾灸的安全性和有效性。艾灸过程中，应避免直接接触皮肤，以免造成烫伤。同时，艾灸后应注意保暖，避免受凉。如果出现不适，应及时就医。