透射电子显微镜和扫描电子显微镜在显微镜领域中各有其独特的应用和优势。通常，透射电子显微镜用于观察超薄样品的内部结构，而扫描电子显微镜则用于观察样品的表面形貌和特征。
1.分辨率：透射电子显微镜的分辨率一般更高，可以达到0.1纳米，适合观察原子级别的结构。扫描电子显微镜的分辨率相对较低，通常在纳米到微米级别，但足以观察样品的表面细节。
2.样品制备：透射电子显微镜要求样品非常薄，通常需要制成几十纳米厚的超薄切片，以便电子束能够穿透样品。扫描电子显微镜则不需要样品如此薄，可以观察到较厚的样品，甚至是完整的生物样本。
3.成像原理：透射电子显微镜通过电子束穿透样品后形成的图像，主要反映样品内部的结构信息。扫描电子显微镜则是通过电子束与样品相互作用产生的信号来形成图像，主要反映样品表面的形貌和成分。
在进行科学研究或医学诊断时，应根据需要观察的样品特性选择合适的显微镜类型。如果需要观察细胞或组织的内部结构，透射电子显微镜可能是更好的选择。而如果需要分析样品的表面特征，扫描电子显微镜则更为合适。在使用这些设备时，建议咨询专业人士，并在必要时寻求专业医疗机构的帮助。