医院检查粪便取样的方法主要有以下三种，一般需根据具体情况进行选择。
1.自然排便法
这是最常用的取样方法。患者需要在排便时，将粪便直接排入医院提供的专用容器中。取样时要注意避免尿液、卫生纸等异物混入，以免影响检查结果。取样量一般需要5-10克，以确保有足够的样本进行检测。
2.肛门指诊法
如果患者排便困难，医生可能会采用肛门指诊法取样。医生会戴上手套，将手指伸入患者肛门内，取出少量粪便样本。这种方法适用于婴幼儿或排便困难的患者。
3.结肠镜检查法
对于需要进行结肠镜检查的患者，医生会在检查过程中，通过结肠镜直接从结肠内取出粪便样本。这种方法适用于需要对结肠病变进行详细检查的患者。
在进行粪便检查时，建议患者注意个人卫生，避免粪便样本受到污染。如果排便困难，可以咨询医生采取相应的措施。在取样过程中，如有任何不适，应及时告知医生。