喉咙在咽口水时感到疼痛可能是由于感冒引起的咽部炎症、扁桃体炎或者咽喉异物等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.感冒引起的咽部炎症
感冒时，病毒或细菌侵犯咽部黏膜，导致咽部红肿、疼痛。治疗时可使用抗病毒药物如阿昔洛韦、利巴韦林，抗生素如阿莫西林、头孢克洛，以及解热镇痛药如布洛芬、对乙酰氨基酚等，应在医生指导下用药。
2.扁桃体炎
细菌性扁桃体炎可引起咽部剧烈疼痛，吞咽困难。常用抗生素治疗，如青霉素、阿莫西林、头孢类等，同时可口服解热镇痛药缓解症状，需遵医嘱用药。
3.咽喉异物
误吞鱼刺、骨头等异物，可引起咽喉疼痛、吞咽困难。应及时就医取出异物，避免自行吞咽馒头、喝醋等错误做法，以免加重损伤。
除以上原因外，还可能与胃食管反流等因素有关。平时注意多喝水，避免辛辣刺激性食物，一旦出现咽喉疼痛，应及时就医明确病因，遵医嘱用药治疗。