同房时深了会痛可能是由于性行为疼痛、生殖道感染或子宫内膜异位症等原因引起的，建议及时就医，根据原因做针对性的改善。
1.性行为疼痛：性行为疼痛可能与润滑不足、生殖器官炎症或心理因素有关。润滑不足时可以使用水溶性润滑剂改善；生殖器官炎症则需使用抗生素如阿莫西林、头孢克肟片、左氧氟沙星等治疗，遵医嘱用药；心理因素则需心理咨询干预。
2.生殖道感染：生殖道感染如外阴阴道假丝酵母菌病、滴虫性阴道炎等可引起性交疼痛。外阴阴道假丝酵母菌病可使用克霉唑阴道片、甲硝唑阴道泡腾片、制霉菌素阴道栓等治疗，滴虫性阴道炎可使用甲硝唑、替硝唑、奥硝唑等治疗，均需遵医嘱用药。
3.子宫内膜异位症：子宫内膜异位症可引起性交疼痛，需使用孕激素类药物如炔诺酮、左炔诺孕酮、地屈孕酮等治疗，遵医嘱用药。
除以上原因外，还可能与子宫肌瘤、子宫腺肌病等因素有关。平时注意个人卫生，避免不洁性生活，出现症状及时就医检查治疗。