甲状舌骨囊肿通常不会自愈。甲状舌骨囊肿是一种先天性发育异常，由胚胎期甲状舌管未完全退化形成，囊肿内含有黏液，随着时间推移，囊肿可能逐渐增大，压迫周围组织，引起吞咽困难、呼吸困难等症状。
甲状舌骨囊肿的治疗主要依赖于手术切除，药物治疗效果有限。常用的药物包括抗生素如头孢类、大环内酯类等，用于控制感染；糖皮质激素如泼尼松、地塞米松等，用于减轻炎症反应；非甾体抗炎药如布洛芬、依托考昔等，用于缓解疼痛。这些药物应在医生指导下使用，遵医嘱用药，避免不良反应。
对于甲状舌骨囊肿患者，建议尽早就医，明确诊断，必要时行手术治疗，以免延误病情。