大便查出蜡样芽孢杆菌通常意味着存在肠道感染，处理方法主要有生活调理、药物治疗和手术治疗等，一般需根据具体情况进行选择。
1. 生活调理：应注意饮食卫生，避免摄入不洁食物，同时增加膳食纤维的摄入，如新鲜蔬菜和水果，以促进肠道蠕动，帮助排出病原体。
2. 药物治疗：在医生指导下，可能需要使用抗生素进行治疗，如阿莫西林、左氧氟沙星和甲硝唑等，以抑制或消除蜡样芽孢杆菌。同时，根据症状可能还需使用止泻药物，如洛哌丁胺，以减轻腹泻症状。
3. 手术治疗：如果药物治疗无效，且感染严重或有并发症，可能需要考虑手术治疗，以清除感染灶或缓解症状。
对于大便查出蜡样芽孢杆菌的情况，建议及时就医，遵医嘱进行合理治疗，并注意个人卫生，预防感染的发生。