阴茎上长痘痘可能是由毛囊炎、皮脂腺囊肿或者性传播疾病等原因引起的，通常需要针对具体原因进行处理。处理阴茎上长痘痘的方法主要有生活调理、物理治疗和药物治疗等，一般需根据具体情况进行选择。
1. 生活调理
保持局部清洁干燥，避免穿过紧的内裤和不透气的衣物，减少局部摩擦和刺激。注意个人卫生，每天清洗阴茎，使用温和的清洁产品，避免使用刺激性强的肥皂或沐浴露。
2. 物理治疗
对于轻度的毛囊炎或皮脂腺囊肿，可以采用局部热敷、冷敷等物理疗法，促进炎症消退。但需注意不要过度刺激患处，以免加重病情。
3. 药物治疗
对于炎症较重或感染明显的痘痘，可在医生指导下使用抗生素软膏如红霉素软膏、氯霉素软膏等外用药物。若怀疑性传播疾病，需及时就医，可能需要使用阿奇霉素、多西环素等口服抗生素治疗。所有药物都应在医生指导下使用，遵医嘱用药。
阴茎上长痘痘应及时就医明确病因，日常生活中注意个人卫生，避免不洁性行为，减少感染风险。